Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms