Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tulp1Q9Z273 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms