Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms