Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sumo3Q9Z172 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sumo3Q9Z172 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms