Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Sh3bp5Q9Z131 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp5Q9Z131 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms