Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Stau1Q9Z108 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stau1Q9Z108 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms