Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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