Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Cldn13Q9Z0S4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Cldn13Q9Z0S4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Cldn13Q9Z0S4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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