Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stxbp4Q9WV89 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Stxbp4Q9WV89 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms