Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms