Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp18Q9WTV6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp18Q9WTV6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp18Q9WTV6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp18Q9WTV6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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