Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms