Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Npas3Q9QZQ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms