Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms