Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmlQ9QZD5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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