Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYJ3

Dnajb1, DnaJ homolog subfamily B member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb1Q9QYJ3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajb1Q9QYJ3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms