Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tomm40Q9QYA2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms