Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd4Q9QY39 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms