Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan3Q9QY33 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms