Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Foxe3Q9QY14 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxe3Q9QY14 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms