Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms