Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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