Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms