Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rabgef1Q9JM13 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rabgef1Q9JM13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1Q9JM13 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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