Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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