Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dclk1Q9JLM8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms