Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms