Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rfx5Q9JL61 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfx5Q9JL61 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfx5Q9JL61 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rfx5Q9JL61 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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