Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms