Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms