Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Irx5Q9JKQ4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Irx5Q9JKQ4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Irx5Q9JKQ4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Irx5Q9JKQ4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Irx5Q9JKQ4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Irx5Q9JKQ4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Irx5Q9JKQ4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx5Q9JKQ4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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