Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms