Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms