Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Riox1Q9JJF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms