Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms