Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.6 ms