Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms