Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tm9sf3Q9ET30 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms