Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem27Q9ESG4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms