Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms