Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Wdr61Q9ERF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms