Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms