Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnft1Q9DCN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnft1Q9DCN7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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