Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xab2Q9DCD2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms