Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrotQ9DC50 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms