Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms