Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms