Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift46Q9DB07 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift46Q9DB07 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift46Q9DB07 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift46Q9DB07 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms