Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhobtb1Q9DAK3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms