Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd8Q9DA37 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms